在接连与黑暗势力的鏖战之后，鬼杀队虽力保宇宙暂时安宁，却也深知，若想彻底根绝隐患，非得探寻黑暗力量的本源不可。一则上古传说在此时浮出水面，传言在宇宙混沌初开之际，有一处神秘灵渊，孕育了最初的灵能，然亦封印着等量的黑暗混沌之源，亿万年来，封印坚如磐石，可近期黑暗势力的频繁躁动，让鬼杀队怀疑封印是否出现松动，那灵渊说不定已沦为黑暗滋生的温床。
炎风决意带队探寻灵渊真相，此消息一出，队员们虽知晓此行九死一生，却无一人退缩。众人驾乘经过特殊改装、能抵御极端能量的星际战舰，朝着宇宙起源之地进发。一路上，穿越诸多古老星系，星辰光芒黯淡昏黄，仿若垂暮老者，散发着古朴沧桑气息，见证过宇宙初生的它们，默默凝视着这支无畏舰队的前行轨迹。舰队航行时，舱内气氛凝重又炽热，队员们或是擦拭保养武器，或是闭目凝神冥想，提升灵力状态，每个人心底都在为即将到来的未知挑战做准备。
临近灵渊，空间愈发扭曲混沌，常规物理法则失效，战舰操控艰难，全凭队员们精湛技艺与灵力强行维持稳定。只见那灵渊仿若巨型黑色漩涡，深不见底，边缘灵能乱流肆意飞舞，似饥饿猛兽择人而噬，稍不留神便会被卷入无尽虚无。一艘护卫舰因稍靠近乱流，瞬间被强大力量拉扯，舰身摇摇欲坠，警报声大作，船员们拼尽全力操控，引擎超负荷运转，才惊险摆脱。
众人小心翼翼步入灵渊范围，瞬间被浓稠黑暗包裹，灵能感知几近失明，唯有凭借彼此间紧密灵力链接，摸索前行。突然，黑暗中涌出一群由纯粹黑暗灵能凝聚而成的“暗影兽”，身形飘忽，利爪却锋利无比，所过之处空间撕裂，发出刺耳尖啸，向众人发起疯狂突袭。队员们迅速背靠背结成剑阵，灵能光芒绽放，抵御攻击，“灵羽闪·暗影破”“炎灵破·混沌袭”等绝技频频施展，刀光剑影与黑暗能量碰撞，激起阵阵狂暴涟漪。一位年轻队员初次面对如此凶悍怪物，心中虽惧，却在队友激励下，咬牙挥剑，竟幸运斩中兽影要害，士气大振。
激战正酣，羽澈察觉到黑暗灵能波动的一丝规律，急呼：“集中攻击暗影兽核心，那里是能量汇聚点！”众人闻言，调整战术，专攻要害，一只只暗影兽在精准打击下消散于无形。可一波未平一波又起，随着深入，脚下地面竟化作灵能沼泽，黏稠吸力大增，不断吞噬众人灵力，行动愈发迟缓。炎风见状，燃烧自身灵能，激发炎灵之力化为炽热护盾，笼罩众人，驱散沼泽寒意，烧干灵液，艰难推进。然而，此举消耗极大，炎风脸色苍白，身形摇晃，却仍屹立不倒，坚守前方。
终于，抵达灵渊核心区域，一座古老而恢宏的封印祭坛浮现眼前，其上符文光芒闪烁不定，裂缝如蛛网蔓延，显然封印已脆弱不堪。更棘手的是，祭坛四周环绕着数位“黑暗灵主”，皆由黑暗本源孕育而生，实力通天彻地，举手投足间便能引发时空震荡，操控黑暗灵能如臂使指。他们现身瞬间，黑暗能量如海啸席卷，压迫感令人窒息。
一场惊心动魄的决战就此打响。鬼杀队全员倾尽灵力，施展出最强灵阵，光芒璀璨试图压制黑暗灵主。炎风率先冲锋，长刀携裹炎灵与不屈意志，斩向为首灵主，却见对方轻轻抬手，便挡下凌厉一击，还以强力反震，炎风虎口震裂，倒飞而出，重重摔在地上，口中溢血。队员们见状，心急如焚，却毫不畏惧，羽澈沟通灵念殿堂，祭出先辈传承秘技“灵耀·混沌破晓”，光芒大放，为众人争取一丝喘息之机。
关键时刻，众人灵机一动，决定借助灵渊本身灵能，逆转封印之力。于是一边与黑暗灵主周旋，一边引导灵能注入祭坛裂缝，修复加固封印。黑暗灵主们自然全力阻挠，攻势如狂风暴雨，能量冲击一波接着一波。鬼杀队咬牙坚持，死伤惨重，伤者强撑着输送灵力，逝者英灵徘徊不散，加持剩余队员。医疗兵穿梭在战场，冒着危险抢救伤员，自身却也伤痕累累；灵力即将耗尽的队员，拼尽最后一丝力气，发动攻击或为队友提供护盾，直至倒下。
历经漫长苦战，封印光芒大盛，终于彻底修复，黑暗灵主们发出不甘嘶吼，被重新封禁于混沌深处，灵渊灵能逐渐平稳，黑暗气息消散殆尽。鬼杀队拖着疲惫身躯，带着牺牲战友英灵，踏上归程。归程战舰内，一片死寂，唯余悲痛沉重的呼吸声，众人目光空洞又满含眷恋，望着牺牲者空位，暗暗发誓定不负英灵期望。
归队后，鬼杀队将此行经历整理成珍贵典籍，存放于灵念殿堂最深处，供后人研习借鉴；同时，依据探秘收获，与联盟合力研发出能主动净化黑暗灵能污染的“灵耀净化装置”，安置于宇宙关键节点，定期巡查维护，守护宇宙纯净；技术人员反复调试装置参数，确保万无一失，安装时更是慎之又慎，不敢有丝毫懈怠。在各星球学府增设“灵渊探秘”课程，培养新一代探险家与守护者，讲述此次惊险历程，传承无畏探索、守护到底的精神，激励年轻一代不断追寻宇宙真相，守护和平之光，直至灵穹澄澈，再无黑暗扰攘，文明永续辉煌，故事在传承中书写新篇，希望在奋进中永不磨灭。校园里，学子们围坐聆听导师讲述，眼中满是憧憬与决然，立志投身守