随着“暗影符文会”的覆灭，多元宇宙进入了一个短暂的休养生息期。各个世界的文明开始重建被符文机关破坏的部分，而守护者联盟则在林羽的带领下，对宇宙中的符文力量分布进行了一次全面的梳理和记录，以防类似的危机再次发生。
林羽在这段时间里，并未停止对签到系统的探索。一日，他被签到系统带到了一个奇异的时空裂缝之中，这里时间与空间相互交错，符文的呈现形式也变得极为复杂。经过无数次的试验与感悟，林羽领悟了“符文时空掌控”能力。这一能力让他能够借助符文的力量，在一定程度上操控时空，如制造时间停滞的区域、开辟短距离的空间通道等。
然而，平静的日子并未持续太久。在宇宙的边际，一股神秘的黑暗势力悄然崛起。他们自称为“暗符圣教”，崇拜一种古老而邪恶的符文之力，妄图将整个多元宇宙拖入无尽的黑暗与混沌之中。“暗符圣教”的成员擅长一种特殊的黑暗符文魔法，能够侵蚀其他生命的灵魂，将其转化为自己的傀儡。
“暗符圣教”首先对一些偏远的弱小文明发动了突然袭击。这些文明在毫无防备的情况下，大量生命被黑暗符文侵蚀，整个星球陷入了绝望与混乱。守护者联盟收到求救信号后，立即派遣林羽带领一支先锋队前去调查。
林羽等人抵达受灾星球时，被眼前的景象所震惊。黑暗符文如黑色的藤蔓般缠绕在城市的废墟之上，被侵蚀的生命眼神空洞，机械地执行着“暗符圣教”的命令。林羽运用“符文时空掌控”能力，短暂地冻结了部分黑暗符文的蔓延，为救援行动争取了时间。
在深入调查过程中，林羽发现“暗符圣教”的攻击似乎有着某种特定的规律，他们总是先攻击文明的能源核心与符文力量源泉，然后再展开全面的灵魂侵蚀。这一发现让林羽意识到，必须尽快找到“暗符圣教”的总部，阻止他们的阴谋。
通过追踪黑暗符文的能量波动，林羽带领先锋队穿越了重重星系，最终来到了“暗符圣教”的总部所在——一座隐藏在暗物质风暴中的巨大符文要塞。这座要塞周围布满了强大的黑暗符文防御阵，任何靠近的物体都会被黑暗力量瞬间吞噬。
林羽没有退缩，他与先锋队成员商议后，决定由他运用“符文时空掌控”能力，制造出一个短暂的空间屏障，掩护其他成员强行突破防御阵。在激烈的交火中，林羽拼尽全力维持着空间屏障，先锋队成员则发挥各自的绝技，与“暗符圣教”的守军展开殊死搏斗。
终于，他们成功突破了防御阵，进入了符文要塞内部。要塞内部弥漫着浓郁的黑暗符文气息，各种邪恶的符文实验正在进行着。林羽在寻找“暗符圣教”首领的过程中，不断破解着一道道致命的符文陷阱。
当他们来到要塞核心区域时，“暗符圣教”的首领——“暗符魔主”出现在众人面前。“暗符魔主”全身被黑暗符文环绕，眼神中透露出无尽的邪恶与傲慢。他嘲笑守护者联盟的不自量力，随即发动了一场强大的黑暗符文风暴。
林羽沉着应对，他将“符文原力铭刻”“符文能量驯服”与“符文时空掌控”三种能力融合在一起，形成了一股强大的对抗力量。他在风暴中铭刻出一道道净化符文，驯服着狂暴的黑暗能量，并利用时空掌控能力，打乱了黑暗符文风暴的节奏。
守护者联盟的其他成员也纷纷加入战斗，他们与林羽紧密配合，有的负责攻击“暗符魔主”的侧翼，有的则保护林羽免受其他敌人的干扰。在激烈的战斗中，林羽发现“暗符魔主”与黑暗符文要塞的核心能量源相连，只要破坏这个能量源，就能削弱他的力量。
于是，林羽冒着巨大的危险，穿越重重黑暗符文攻击，冲向能量源。在接近能量源的瞬间，他施展出了自己的最强一击，将一道蕴含着三种能力融合之力的符文打入能量源中。
随着一声巨响，黑暗符文要塞的能量源开始崩溃，“暗符魔主”的力量也随之锐减。守护者联盟抓住机会，发动了最后的总攻。经过一场惊心动魄的生死较量，“暗符魔主”终于被击败，“暗符圣教”也随之土崩瓦解。
此役过后，多元宇宙的文明对守护者联盟更加崇敬与感激，而林羽也成为了多元宇宙中永远的英雄传奇。但林羽知道，宇宙的未知永远没有尽头，他带着签到系统，继续踏上那充满挑战与神秘的探索之路，守护者联盟也时刻准备着应对下一次未知的危机，守护多元宇宙的和平与希望之光永不熄灭。