正向着桧扇市前进的游轮，在有着一个名为P2实验室的破旧实验室的岛屿港口停了下来。
此刻小智几人正在甲板上悠闲地吹着海风，突然在下方注意到一位戴着黑白色的鸭舌帽，浅绿色长发的青年站在港口上看着他们。
“小智哥，你认识他吗？”芽衣疑惑的询问道。
“不，我第一次见到他！”小智闻言摇了摇头，虽然如此，小智却感觉的到他身上有着特殊的能量。
艾莉丝顿时有些好奇，“那他为什么一直看这里呢？”
“应该是因为皮卡丘吧！”透子开口道，“毕竟在合众地区皮卡丘可是很稀有的！”
众人闻言感觉很有道理，转头再看向码头这才发现那名青年已经不见了踪影。
众人对此也没有在意，过了一会儿，游轮补给好物资，再度开始了行驶。
就在这时，艾莉丝突然开口道，“对了，我发现船上有神奇宝贝对战的练习场哦！”
“好，既然这样，大家一起看看吧！”小智当即提议道，顿时得到了众人的一致认可。
来到船上的对战场地，芽衣满眼兴奋的看向小智，“小智哥，要不要来一场？毕竟咱们在联盟大会上没有碰到，怪可惜的！”
透子无语道，“你连我都打不过，竟然还挑战小智哥！”
芽衣鼓着脸狠狠地瞪了透子一眼，“你只是运气好而已，下次一定是我赢！”
还没等小智回答，皮卡丘与伊布好像突然发现了什么，直接从小智肩膀上跳了下来。
众人疑惑的顺着它们两个的方向望去，这才发现那名青年正向众人的方向走来。
只见那青年走到皮卡丘与伊布身前，蹲下身来，抚摸皮卡丘与伊布的脸颊，它们两个竟然没有反抗，“真可爱！”
“谢谢你的夸奖！”小智抱着美洛耶塔上前，“对了，之前你是不是一直向我们这边看？”
“因为我听到了朋友的声音啊！”青年没有否认，随即看向美洛耶塔、比克提尼、胡帕以及幻化人形的拉帝亚斯。
对于这些幻之神奇宝贝似乎并没有感到惊讶，一直保持着微笑。
“朋友吗？”小智闻言眼神一亮，他自然知道这名青年所说的朋友指的什么，“我和神奇宝贝们一直都是朋友！”
“我知道，所以我才认可你，小智搜查官！”青年随即进行了自我介绍，“在这里见到你真的很意外！你们好，我的名字叫做N！”
“皮卡丘它们可是说很喜欢你，虽然你让朋友战斗让我很不喜欢，但我并不讨厌你！”
小智顿时眼神一凝，从他的话语中不难听出他似乎可以了解神奇宝贝的内心，而且是冲他来的。
于是众人也进行了自我介绍，一起来到餐桌边交谈了起来，N并没有拐弯抹角，而是直接挑起了话题，“小智，你知道捷克罗姆与莱希拉姆吗？”
“合众的黑白神龙我自然认识！”小智点了点头，“你想表达什么？”
“其实我一直不断的在寻找答案，为什么这个世界会有神奇宝贝存在？为什么会生于这个世界？为什么世界会是这样的形态？神奇宝贝现在真的过的幸福吗？”N突然自言自语起来，情绪仿佛很是激动。
“再这样下去，各种价值观交汇而成的世界将会变得一片灰暗，我不能允许这种事发生，该怎么做才能让神奇宝贝成为完整的存在？如果能够见到传说中的神奇宝贝捷克罗姆和莱希拉姆，或许就能知道形成世界的原因，说不定就能改变世界了！”
“呃，抱歉，一个人自顾自的兴奋起来了！”
“我能感觉的到你是真心为神奇宝贝思考！”小智摇摇头，然后摸了摸旁边的皮卡丘，“但是我们的时代已经很好了，曾经的神奇宝贝世界弱肉强食，战争不断！现在呢？”
“我们身处和平年代，这无疑是幸福的！”小智认真的看着N，“以精灵球为介媒，我们和神奇宝贝一起战斗成长，建立羁绊，这不是很好吗？”
“羁绊吗？”N紧接着苦笑一声，“虽然我认可你与神奇宝贝之间的羁绊，但其他人呢？曾经的等离子队打着解放神奇宝贝的口号，实际上却......”
“等离子队？”小智的脑海中突然涌现出了有关等离子队的所有记忆，他终于想起了这个眼前的青年，等离子队的王——N！
虽然只是个傀儡，但曾经确实是等离子队的王，得到了传说神奇宝贝真实之龙莱希拉姆的认可。
只是却没有能力控制莱希拉姆，直接将等离子队的城堡给毁灭，自此这才脱离了等离子队，体会到人生百态与调查之后，这才发现他被骗了！
接着N便将说起了他的身世，与小智了解的大差不大，N认真的看向小智，“小智，等离子队不会就这么容易放弃！我知道以我一个人的力量绝对对抗不了他们，所以了解到你之后，我决定找你进行合作！”
“现在，在所有人中除了荷莲娜与巴贝娜，我唯一可以信任的就只有你了！”
随着小智的名声越来越盛，N也对小智进行了调查，发现小智的实力不仅强大，而且已经摧毁了丰缘地区与神奥地区的邪恶组织，就连火箭队都没有在小智手