在完成新木叶的初步整顿之后，宇智波德光先是逼迫大蛇丸交出了木遁实验计划的所有技术细节资料，然后又令其设计了一套细胞特殊查克拉物质提取的实施方案。
在原三代目猿飞日斩陨落之后，警务部部队立即封锁了暗部基地、内务部基地以及火影大楼，在确认情报属实之后，警务部部队迅速杀入暗部基地，抓拿了其中的相关人员，并将一切绝密资料、秘密实验室一锅端了。
虽然当时大蛇丸因身处战后才查处的内务部基地而免遭牢狱之灾，但储存于暗部基地的资料和设备全部被警务部查封带走，可谓是血本无归。
虽然大蛇丸亦上门拜访以示投诚，但宇智波德光嘴上说得好好的，内心却半点都不信这条毒蛇说的任何一句话。
所以，虽然设置在死亡树林的内务部实验室仍然允许大蛇丸继续使用，并在资金上也继续支持了原有的研究，但实验室系统也被执掌内务部的宇智波仲玄安插进了一大堆行政人员，为大蛇丸和原有研究员提供了无微不至的“贴身保障”。
当然，绩效考核2.0版本也在内务部实验室中推行开来。
除了原有的研究课题之外，今后所有的新设立研究项目除了宇智波德光特别关照的，均需撰写计划书、进度表，还得事无巨细地编制资金预算，一整套连招把大蛇丸整得欲仙欲死。
但大蛇丸还是咬着牙坚持了下来，宇智波德光索要的木遁实验计划所有的技术细节以及失败原因都事无巨细地交代了出来，并完成了宇智波德光指定的特别课题，而且还因此重新获得了原暗部基地中的一部分实验仪器的使用权。
只不过，如果大蛇丸觉得这样就能获得宇智波德光的信任而被松开脖子上的套索，那他就大错特错了。
……
宇设立于涡之国旧土的伏波城也随着宇智波德光晋任征夷大将军、木叶总督之后而再次扩建，在再次返回幕府郡城之后，宇智波德光先是向归义三族忍军大发犒赏，作为他们选择仍然留在幕府帐下而不是要求归化加入木叶的额外补偿，并承诺未来待遇只增不减，同时亦再次暗示幕府对水之国以及雾隐的态度出来从来未曾变化，率领众人打回雾隐忍村拨乱反正仍然是征夷幕府的最高作战任务云云。
同时，宇智波德光又在原涡潮忍村以南划拨了一大片地皮作为漩涡一族的保留地，将其赐予漩涡苇名一系作为世袭罔替的封地。
漩涡一族则满怀感激之情接受了宇智波德光的封赐，非常顺畅的完成了从盟友到家臣的法理转变。
于是，九尾人柱力漩涡玖辛奈叶从此在法理上脱离了木叶忍村的法统束缚，成为宇智波德光麾下的家臣之一。
虽然木叶忍村之中，极少有人能看懂宇智波德光这一连串貌似脱裤子放屁的操作的意义何在，但各国大名却感到异常惶恐。
这是毫不掩饰的建国立邦、自置臣僚的行为！
但火之国大名因其与原三代目猿飞日斩合作培训的忍军在其陨落后便从此停滞，滞留在内务部的大名臣属亦不知所踪，再加上内战后的木叶也实现了平稳过渡，大名实在找不到抓手进行制衡，所以也只能视若不见，任由宇智波德光在涡之国“化外之地”继续折腾。
但奉命出使幕府的水之国特使近卫笃司就没那么淡定了。
在抵达南部群岛之后，水之国使团就被宇智波德光授意分管防区的辉夜忍者将其软禁了起来。
宇智波德光暂不打算和水之国大名虚与委蛇，他有更重要的事情要做。
那就是白绝细胞的高浓度提取和柱间细胞的无害化处理。
……
在经过轮番大战且高强度使用万花筒写轮眼之后，宇智波德光的视力已经下降了不少，根据前世的经验判断，当前的视力将近于300度近视的水平，虽然不算非常严重，但这也是一个迫在眉睫的问题。
宇智波德光的实力，有大半是寄托在万花筒写轮眼之上的，这也关乎个人实力，绝对马虎不得。
根据大蛇丸提供的查克拉细胞物质提取实施方案，漩涡研究员们经过一番论证，进行了一些细节上的调整之后，很快就搭建起了一个小型的离心机和查克拉反应堆。
虽然仪器的名字听上去有一种莫名的既视感，但宇智波德光还是就此进行白绝细胞的提炼。
漩涡一族转变为家臣身份之后，宇智波德光也不再藏着掖着，而是直接将珍藏已久的白绝尸体拿了出来进行初步实验。
虽然漩涡研究员对这具造型奇特的尸体感到非常的惊奇，但也很有自知之明地没有多问，而是迅速投入初步提取实验之中。
第一轮使用截取了白绝尸体的一个小指头进行提取。
宇智波德光坐在实验实施区背后的观察室，通过厚厚的玻璃观察着漩涡研究员的操作。
白绝是当之无愧的忍界瑰宝。
这种早在辉夜临世时期通过神树人为制造出来的所谓“兵器”虽然大部分力量羸弱，但无一例外，他们都具备着极强的再生能力，部分经过特殊强化的个体甚至还能使用强力忍术，具备超强的战斗力。
而宇智波德光所抓捕到的白绝也不知道是辉夜的原版